Chevy Blog

射,有似乎君子,失诸正鹄,反求诸其身。

cellranger 6.1.1使用教程

涓涓不塞，将为江河。

cellranger 6.1.1使用教程 本教程更新时间为2021-09-03 涉及Linux和R使用 1. cellranger 6.1.1 下载 cellranger已经预编译好了CentOS/Redhat 6.0+和Ubuntu的二进制文件。 $ curl -o cellranger-6.1.1.tar.gz "https://cf.10xgenomics.com...

Posted by Chevy on September 3, 2021

春晖の假期记录

坐看黑云衔猛雨，喷洒前山此独晴。

春晖の假期记录 Day1 Day2 起床以后，有点昏昏沉沉，其实昨晚十二点半就睡啦，睡前还小喝了半瓶啤酒，想到今天还要去实验室，不禁一阵心烦意乱。 中午去实验室吃了一根香蕉🍌，处理了下细胞，然后开始思考如何逃离。 逃离的第一步：就餐补充好能量，这次我选择的是团购套餐——棒！约翰 一个人吃两人套餐真的很顶，下午一点多的时候，整个店里都没人啦，店里的员工们就全员注视我一个干完了一...

Posted by Chevy on August 11, 2021

计算二代测序数据的Insert size和standard deviation

涓涓不塞，将为江河。

Solution 1：Picard的CollectInsertSizeMetrics命令 该工具为验证文库构建提供了有用的指标，包括双端文库的插入大小分布和读取方向。 预期的文库指标数据与建库方法有很大的关联。 CollectInsertSizeMetrics命令输出的结果包括一个histogram和一个dataframe，包括fragment的的统计信息。 使用示例： java ...

Posted by Chevy on August 3, 2021

忘记匿名

远客岂知今再到，老僧能记昔相逢。

Something to talk 感情这个世界，善良的人是不会有好下场的。 越是小说里令人神往心驰的，现实中就越是难以遇到。 当然无敌的状态是你不要把对方看的太重，无欲则刚，只要你不当真就没有人可以伤害你。 但是矛盾的地方在于，不认真的话那又怎么能谈得上是恋爱呢。 这问题无解。

Posted by Chevy on July 13, 2021

复刻一篇文章里面的图片

layout: post title: 复刻一篇文章里面的图片 subtitle: 一息尚存，此志不容少懈。 date: 2021-05-24 author: Chevy header-img: img/42.png catalog: true tags: 技术学习笔记 style: plain — 原文图片 复刻图片 已对敏感信息进行处理： 附上代码 xl_d...

Posted by Chevy Blog on May 24, 2021

R语言对RNA-seq画火山图

谢却海棠飞尽絮，困人天气日初长。

首先安装我们会用到的包并加载 # 安装tidyverse install.packages("tidyverse") install.packages("ggrepel") library(tidyverse) ## -- Attaching packages ----------------------------------------------------------------...

Posted by Chevy on May 14, 2021

R语言读入Excel多个sheet数据

云雨无情难管领，任他别嫁楚襄王。

子标题 readxl::read_excel(): importing multiple worksheets 介绍 readxl包是一个用于读入Excel数据（包括.xls, .xlsx为文件）到R里面的包。 当然除了readxl包以外还有一下这些包可以做到：1）返回sheet的名称；2）读入每个sheet的数据： “XLConnect” “gdata” “xl...

Posted by Chevy on April 26, 2021

R语言时间系列作图

努力尽今夕，少年犹可夸。

自我督促早点睡觉 Nicole最近最近和我发起了一项早睡早起的健康活动。 为了持续记录我的入睡时间，花了一小时造了个轮子，予以记录。 其实写的非常的琐碎，很多地方完全没有考虑逻辑优化，不过R语言还要啥优化啊，出图就行。 后续待更新： 添加时间区域图片（明早组会的时候摸鱼找几张） scale到月份进行统计 争取全自动化录入+输出作图 如有还有精力的话，开...

Posted by Chevy on March 24, 2021

iPhone拍摄的MOV视频文件转化为MP4格式

青春的动人之处，就在于勇气，和他们的远大前程。

准备 Linux系统 安装了 ffmpeg conda install -c conda-forge ffmpeg iPhone导出到电脑里的MOV文件 脚本 processvideo() { filename=$1 ext=$2 destination=$3 pathbase=$4 encodedfilena...

Posted by Chevy on February 25, 2021

狮子座们的野望

21年的年度词汇：运动

2021-01-31 年后的第二次聚会，狮子座们约了“朱雀打边炉”。 约了十二点，结果十一点半的时候，艳红发了一个表情·裂开了，睡过了。 好在大家还是差不多一起抵达了聚餐地点，但是早晨起床对大家来说还真的是一个big challenge！ 莫斯卡托、鸡汤、冻柠茶 席间大家友好的交换了近期的情感情报并毫不掩饰的指出了大家都长胖了这个事实，然后点了一堆吃不完的菜。 艳红说他约好了...

Posted by Chevy on February 1, 2021

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