面面的徐爷

解剖逻辑生长曲线

不辞山路远，踏雪也相过。

参考文章: ic50-calculator logistic growth curve 我们先画几个图来说明一下 library(tidyverse) theme_set(theme_minimal()) points <- tibble( age = c(38, 45, 52, 61, 80, 74), prop = c(0.146, 0.241, 0.571, 0...

Posted by Chevy on December 5, 2022

Shiny中的reactive及reactivevalue

Shiny中的reactive及reactiveValue 数据响应原文链接我们使用的server端函数都是自动响应数据变化的函数。但那些都是“动作”类型的函数，如renderPlot进行绘图，renderText输出文本，observe监测ui端变化并响应。如果server端需要一个仅用于存储ui端数据的变量，该怎么做呢？很自然的想法是直接使用赋值语句：让我们首先来看一段...

Posted by Chevy Blog on October 4, 2022

R 随笔

纸屏石枕竹方床，手倦抛书午梦长。

1. 三种方法去除data.frame里面的空列对于去除data.frame里面的空行，对R来说比较简单，na.omit即可。但是去NA或者空列的话，就需要花点脑筋。 0. 构建一个data.frame数据 my_df <- data.frame(X1 = c(1:10), X2 = rep(NA, 10), ...

Posted by Chevy on August 29, 2022

ggplot2 tricks

博学之，审问之，慎思之，明辨之，笃行之。

ggplot2 tricks 1 How to remove black border around plots/graphics in ggplot2? 针对theme_clean()这个主题我们都会遇到这个问题，画出来的图都会带一个黑框。可以在theme()函数里面进行解决。 library(ggplot2) library(ggthemes) data(mtcars) ggplo...

Posted by Chevy on July 29, 2022

简单记录boxplot可视化作图

君子不以冥冥堕行。

plot boxplot with significance marker library(tidyverse) library(pheatmap) library(RColorBrewer) library(ggrepel) library(multcompView) library(ggpubr) library(cowplot) fpkm <- readxl::read_xls...

Posted by Chevy on May 22, 2022

栅栏内外天与地（转载）

覆舟水是苍生泪，不到横流君不知。

作者：陆鱼链接：https://www.zhihu.com/question/531940348/answer/2480275924 来源：知乎著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权，非商业转载请注明出处。我称这种现象为财政供养困局。例如我县实际常住人口九十万人，拥有五家A股上市企业，另有三十几家制造业上市企业在我县开立了分公司，规模以上制造业企业四百多家，三个省级工业园区...

Posted by Chevy on May 13, 2022

配置iTerm2+oh-my-zsh

今夜偏知春气暖，虫声新透绿窗纱。

前言得空把手上笔记本的iTerm2和zsh配置了一下，记录一下以备后续使用。本教程学习自： mac之 iTerm2 + Oh My Zsh 终端安装教程 iTerm2 配置和美化 - 少数派一、iTerm2配置 1. 首先，下载iTerm2来替换默认终端。 iTerm2 2. 调整Status Bar 将 iTerm2 自带 theme 修改为 Minimal ...

Posted by Chevy on May 3, 2022

R语言解决内存溢出

故国别多日，故人无少年。

问题描述当我使用R处理数据的时候，遇到大的数据就会容易内存溢出报错，报错信息如下： vector memory exhausted (limit reached?) 问题解决方案1 R语言作为把数据存在内存里面的软件，清除掉不用的对象是一个简单即时可用的办法： rm(large_df, large_list, large_vector, temp_variables) 问题...

Posted by Chevy on April 3, 2022

提取heatmap作图中的cluster行名或者列名

业无高卑志当坚，男儿有求安得闲。

此post旨在提取heatmap作图中的cluster行名或者列名其实，对heatmap热图提取cluster就是对hclust的结果提取cluster，tree_col和tree_row属性首先，我们要构建一个matrix或者data.frame进行pheatmap作图 # package library library(pheatmap) library(tidyver...

Posted by Chevy on January 14, 2022

多设备git同一个账号到GitHub的同步问题

离心迸落叶，乡梦入寒流。

最近在编辑bookdown，并且将这本Linux_Shell_Script托管到GitHub pages上。现在用两个设备本地建立git仓库后同步到同一个GitHub的repo上，更换设备进行编辑的时候，首先会git pull，经常会导致出现冲突《当GitHub的文件和本地文件不一致的时候，git pull命令会自动merge冲突，再让你手动修改》我的需求是，以remote...

Posted by Chevy on December 10, 2021

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