面面的徐爷

ggplot2_plot_raster

一悟归身处，何山路不通。

Shwo how to ggplot2 using stat_density 使用geom_raster来画这张图 Reference: https://ggplot2.tidyverse.org/reference/geom_tile.html library(tidyverse) ## ── Attaching core tidyverse packages ─────...

Posted by Chevy on January 30, 2024

春晖の学习资源整合

秋色从西来，苍然满关中。

引言对于看到过的很棒的R语言学习网站，现予以整理，以待后览 Topic Description Link 学习网站用rmarkdown定制你的数据分析报告 - 今日使用mageck有感- 我要做R语言全栈...

Posted by Chevy on January 26, 2024

How to calculate correlation R2 and slope

不采百花，难酿好蜜。

Using rstatix do quick calculation library(tidyverse) library(rstatix) iris %>% group_by(Species) %>% cor_test(Sepal.Width, Sepal.Length, method = "pearson") ## # A tibble: 3 × 9 ## ...

Posted by Chevy on January 26, 2024

Posting Rmarkdowns to your Jekyll website

蟠木不雕饰，且将斤斧疏。

前言最近习惯使用rmarkdown来写东西，主要好处是能够兼容图片，还可以一键推送到RPubs。但是rmakrdown写完以后，遇到一个问题，以往使用markdown写的记录，可以很方便的转到Jekyll里面的post生成blog用于记录和分享，rmakrdown是不兼容的，但是保留脚本生成的图片其实还是我的刚需，所以就Jekyll和rmarkdown的联通做了一些搜索，予以记...

Posted by Chevy on January 24, 2024

Install Rstudio Server introduction

君子欲讷于言而敏于行。

本文由简悦 SimpRead 转码，原文地址 claudiu.psychlab.eu Tutorials from Claudiu’s blog Install R (r-base) 1. Install helper software software-properties-common and dirmngr software-properties-c...

Posted by Chevy on January 22, 2024

小韩语录

吾任天下之智力，以道御之，无所不可。

小韩语录我和小韩在小区公园里面带宝宝玩的时候，小韩发现了几只小猫和猫妈妈，陪着她们玩了好一会，临走的时候，小韩给猫咪们打招呼说“我们先走了，下次带大顺姐姐不吃的火腿肠来喂你们”，我很疑惑问“大顺哪有火腿肠吃？”，小韩偷偷说“是没有火腿肠，我说给她们听的”

Posted by Chevy on January 6, 2024

Rstatix calculate correlation R2 and slope

君子欲讷于言而敏于行。

测试在R里面，使用tidyverse搭配rstatix更简便的做计算，例如t.test()/cor() library(tidyverse) library(rstatix) iris %>% group_by(Species) %>% cor_test(Sepal.Width, Sepal.Length, method = "pearson") bdims_sum...

Posted by Chevy on November 28, 2023

SPR数据的建模及作图

转载学习来源

本文由简悦 SimpRead 转码，原文地址 stackoverflow.com I am trying to fit association-dissociation SPR kinetics data for a protein and small molecule for two concentrations using ggplot2. The data is here...

Posted by Chevy on November 2, 2023

Subcellular Location Database tidy

读书不下苦功，妄想显荣，岂有此理？

本文讨论对于不规则数据的简单处理数据来源：https://www.uniprot.org/uniprotkb?query=%28keyword%3AKW-9998%29&facets=model_organism%3A9606 library(tidyverse) # read in raw data ---------------------------------...

Posted by Chevy on October 23, 2023

R语言igraph学习路径

远客岂知今再到，老僧能记昔相逢。

本文讨论igraph的使用准备工作首先我们需要使用igraph是因为在protein-protein-interaction或者disease-gene中networking visualization是很重要的，而igraph就是一个很好的用来展示的方法 Protein-protein-interaction或者disease-gene的相互关系来自DisGeNET da...

Posted by Chevy on March 1, 2023

Chevy Blog

ggplot2_plot_raster

一悟归身处，何山路不通。

春晖の学习资源整合

秋色从西来，苍然满关中。

How to calculate correlation R2 and slope

不采百花，难酿好蜜。

Posting Rmarkdowns to your Jekyll website

蟠木不雕饰，且将斤斧疏。

Install Rstudio Server introduction

君子欲讷于言而敏于行。

小韩语录

吾任天下之智力，以道御之，无所不可。

Rstatix calculate correlation R2 and slope

君子欲讷于言而敏于行。

SPR数据的建模及作图

转载学习来源

Subcellular Location Database tidy

读书不下苦功，妄想显荣，岂有此理？

R语言igraph学习路径

远客岂知今再到，老僧能记昔相逢。

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