background: 所里的老师另谋高就了，他负责的服务器也不给用了，那两天我帮大家备份了一波数据，没想到忘了把我的数据备份起来（事实上我实在的觉得我自己备份了）
今天整理的数据的时候，发现我之前测的一批RNA-seq数据好像没有备份在硬盘里，惊出一身冷汗。
平台老师走了，服务器也搬离了，原来这个世界上没有什么是可以永远存在的，当我意识到这件事的时候我的数据已经被我rm -rf ./*了。
好在之前导出到电脑里有两个bam文件:cry:（只占到四个数据里面的两个），所以亡羊补牢的把bam转化为fastq再备份一下吧，简单的做个记录：
# 首先使用samtools将bam文件按照name排序
samtools sort Ka-12-1.bam -n -O BAM -o Ka-12-1.sorted.bam -@ 4
# 随后再使用bedtools的bam2fastq将bam转化为fastq
bedtools bamtofastq -i Ka-12-1.sorted.bam -fq Ka-12-1_1.fastq -fq2 Ka-12-1_2.fastq
最后还得重新比对一下，反正有啥问题（到时候还得上传GEO，一切顺利吧希望）
